Elle organise ses activités scientifiques autour de 4 grands pôles thématiques en partenariat avec les organismes de recherche et les grands instruments internationaux présents sur le site.

- Chimie, Sciences du vivant et de la santé, Bio ingénierie (CSVSB)
- Mathématiques, Sciences et technologies de l'information et de la communication (MSTIC)
- Sciences Humaines et Sociales (SHS)
- Sciences de la Matière, de l'INGenierie Univers et Environnement (SMINGUE)