L’université Joseph Fourier regroupe 14 composantes dont :
7 Unités de formation et de recherche (UFR) disciplinaires : APS (activités physiques et sportives), Chimie-Biologie, Géographie (IGA), IM2AG (informatique, mathématiques et mathématiques appliquées), PhITEM (physique, ingénierie, Terre, environnement, mécanique), Médecine, Pharmacie ;
4 écoles et instituts : Institut universitaire de formation des maîtres (IUFM), Institut universitaire de technologies (IUT1), Observatoire des sciences de l'Univers de Grenoble (OSUG), Polytech Grenoble ;
3 composantes transversales : Collège des écoles doctorales, UJF Valence, Département de la licence sciences et technologies (DLST).
L’UJF comprend aussi des structures de soutien à l’enseignement supérieur et la recherche telles les bibliothèques et le dispositif Grenoble Sciences.